截至2025年6月末，博瑞医药累计申请专利 549 件，其中发明专利 486 件；拥有有效专利 279 件，其中发明专利 228 件，布局了美国、日本、加拿大、欧洲、韩国等多个国家和地区。公司拥有 146 件注册商标，其中 5 项香港及海外注册商标 ，商标数量在本行业内全国名列前茅。

博瑞医药于2010 年设立独立的知识产权管理部门，由董事长袁建栋担任第一责任人，知识产权部目前配备有专职知识产权工作人员3位，其中2人为专利代理师，1 人具备专利代理资格证和法律职业资格证双证资格。博瑞医药已建立了成熟的知识产权管理体系，公司于2016 年、2021 年两次通过知识产权管理体系国标（GB/T29490-2013）认证，在符合知识产权管理体系国标的基础上，博瑞医药在集团内部建立了知识产权奖励制度、知识产权申请制度、知识产权运营制度等知识产权管理制度，并且在2022年建立了高价值专利培育中心。